而這時群臣開始上本，認為皇弟朱由檢年齡已大，請求皇帝封其為王。太子的出生，這本來就是題中應有之義，于是皇帝封朱由檢為信王，至于他的封地，群臣商議后，希望皇帝將信王封在廣西南寧府。
　　
　　朱由校覺得廣西太遠，建議重新找一個近一些的地方安置信王，卻又被群臣一致反對。葉向高說得有些直白：“遠者則可安皇親之心。”而一向講究字斟句酌的大臣們都覺得這句話說得好，說得妙，說得哌哌叫。
　　
　　朱由校無可奈何，同意將信王分封到南寧府。但以南寧不靖為由，將信王暫時留在京城，雖然群臣反對，但在他的堅持下，最后他們只得勉強同意。
　　
　　而在七月初，京師大學堂舉行了第一次考試，朱由校稱之為期考，正式名稱叫半年考。這次考試結果，讓經(jīng)歷過后世教育的朱由校目瞪口呆：師范學院和吏員學院竟然是全部合格，而且優(yōu)秀率達到了九成。
　　
　　其實這是他的慣性思維作怪，后世學生會出現(xiàn)厭學的情況是因為當時已經(jīng)是全民教育，總會有部分人對學習沒有興趣，這很正常。而在這個時代，受教育的機會本來就少，而象在京師大學堂這樣的環(huán)境里免費學習，更是自古未有之事，大家珍惜這樣的機會都還來不及，又如何會出現(xiàn)厭學的情況呢。
　　
　　而研究院的學生則分為六科，其中的農(nóng)事和器械兩科的學生根本就沒有在教室里上過課，直接實習。
　　
　　農(nóng)事科分為兩個小班，一個小班在上林苑監(jiān)跟著良牧、蕃育、林衡、嘉蔬四署的署丞實習，另一個小班則在司苑局里跟著那些老農(nóng)學習。
　　
　　器械班則直接進入兵器局，按照自己的興趣，選擇盔甲，火銃，火炮三類，跟著兵器局的三位侍郎學習。
　　
　　天文地理算術醫(yī)藥等四科的學生則在大學堂里學習，徐光啟和西洋傳教士可以做天文地理算術的教授，而醫(yī)藥則是由太醫(yī)院的太醫(yī)來做教授。
　　
　　而皇帝朱由校先生，則是唯一的六科教授。
　　
　　五月十一早上，他用過早膳后，客氏說道：“今天是農(nóng)學，皇上，您干嘛要去教學生農(nóng)事呢，您自己又沒干過，有那么多老農(nóng)民，伺候了一輩子莊稼，他們不會嗎？”
　　
　　朱由校笑道：“奶媽你就不知道了，他們知道如何栽種莊稼，可是他們不知道為什么要這樣做，至于我知道的一些東西，他們聽都沒聽說過，雖然我沒干過農(nóng)活，但我比老農(nóng)更懂得如何增產(chǎn)，這個叫知識的力量?！?br/>　　
　　他洋洋得意地來到司苑局，農(nóng)事班的班長宋應星上前對他作了一個揖道：“陛下，今天要講育種了?！保ㄖ煊尚Ｒ?guī)定，在他當教授期間，學生只需對他行作揖禮，不用跪拜。）
　　
　　宋應星是一個舉子，三十多歲，多次會試不第后，已經(jīng)絕了科舉之念。正好這次京師大學堂招生，他就來考農(nóng)事，結果成績很好，被任命為農(nóng)事班的班長。
　　
　　朱由校笑道：“好的，讓他們來大堂吧。”
　　
　　在司苑局的大堂里有一塊黑板，朱由校進了大堂，學生一起起立行禮道：“老師好！”
　　
　　朱由校揮了揮手道：“同學們好，今天我們開始講遺傳問題。什么是遺傳呢？我們把一粒南瓜種子栽進土中，一段時間后就會長出一株南瓜來，而不會長出冬瓜來，我們平常說的種瓜得瓜，種豆得豆，就是遺傳現(xiàn)象?！?br/>