天啟元年四月，遼陽(yáng)覆。廷議設(shè)天津巡撫，專飭海防，改畢自嚴(yán)右僉都御史以往。置水軍，繕戰(zhàn)艦，備戎器。及熊廷弼建三方布置策，天津居其一，增設(shè)鎮(zhèn)海諸營(yíng)，用戚繼光遺法，水軍先習(xí)陸戰(zhàn)，軍由是可用。魏忠賢令錦衣千戶劉僑逮天津廢將，畢自嚴(yán)以無(wú)駕帖疏論之，報(bào)聞。四方所募兵日逃亡，用畢自嚴(yán)言，攝其親屬補(bǔ)伍。兵部主事來(lái)斯行有武略，畢自嚴(yán)請(qǐng)為監(jiān)軍。山東白蓮妖賊起，來(lái)斯行率五千人往，建功頗多。

    萬(wàn)歷四十六年時(shí)，因遼左用兵，議行登、萊海運(yùn)。萬(wàn)歷四十七年二月，特設(shè)戶部侍郎一人，兼右僉都御史，出督遼餉，先帝乃命畢自嚴(yán)代。敘前平賊功，進(jìn)右都御史兼戶部左侍郎。時(shí)議省天津巡撫，令督餉侍郎兼領(lǐng)其事，即以委畢自嚴(yán)。又議討朝鮮，畢自嚴(yán)言不可遽討，當(dāng)俟請(qǐng)貢輸誠(chéng)，東征效力，徐許其封耳。京師數(shù)地震，因言內(nèi)批宜慎，恩澤宜節(jié)，人才宜惜，內(nèi)操宜罷，語(yǔ)甚切直。畢自嚴(yán)在事數(shù)年，綜核撙節(jié)，公私賴之。

    天啟五年，以右都御史掌南京都察院。天啟六年正月，就改戶部尚書(shū)。魏忠賢議鬻南太仆牧馬草場(chǎng)，以助三大殿工。畢自嚴(yán)持不可，遂引疾歸。

    崇禎元年，畢自嚴(yán)以度支大絀，請(qǐng)核逋賦，督屯田，嚴(yán)考成，汰冗卒，停薊、密、昌、永四鎮(zhèn)新增鹽菜銀二十二萬(wàn)，俱報(bào)可。畢自嚴(yán)又上疏言：“諸邊年例，自遼餉外，為銀三百二十七萬(wàn)八千有奇。今薊、密諸鎮(zhèn)節(jié)省三十三萬(wàn)，尚應(yīng)二百九十四萬(wàn)八千。統(tǒng)計(jì)京邊歲入之?dāng)?shù)，田賦百六十九萬(wàn)二千，鹽課百一十萬(wàn)三千，關(guān)稅十六萬(wàn)一千，雜稅十萬(wàn)三千，事例約二十萬(wàn)，凡三百二十六萬(wàn)五千有奇。而逋負(fù)相沿，所入不滿二百萬(wàn)，即盡充邊餉，尚無(wú)贏余。乃京支雜項(xiàng)八十四萬(wàn)，遼東提塘三十余萬(wàn)，薊、遼撫賞十四萬(wàn)，遼東舊餉改新餉二十萬(wàn)，出浮于入，已一百十三萬(wàn)六千。況內(nèi)供召買，宣、大撫賞，及一切不時(shí)之需，又有出常額外者。乞敕下廷臣，各陳所見(jiàn)?！?br/>
    于是廷臣爭(zhēng)效計(jì)畫(huà)。畢自嚴(yán)擇其可者，先列上十二事，曰增鹽引，議鼓鑄，括雜稅，核隱田，稅寺產(chǎn)，核牙行，停修倉(cāng)廒，止葺公署，南馬協(xié)濟(jì)，崇文鋪稅，京運(yùn)撥兌，板木折價(jià)。已，復(fù)列上十二事，曰增關(guān)稅，捐公費(fèi)，鬻生祠，酌市稅，汰冗役，核虛冒，加抵贖，班軍折銀，吏胥納班，河濱灘蕩，京東水田，殿工冠帶。帝悉允行。

    崇禎皇帝詔輯《賦役書(shū)》。畢自嚴(yán)言：“《書(shū)》之作，自行一條鞭始，距今已四十五年。有一事而此多彼少者，其弊為混派；有司聽(tīng)奸吏暗灑瓜分，其弊為花派。當(dāng)大為申飭?！币驐l八式以獻(xiàn)。帝即命頒之天下。

    給事中汪始亨極論盜屯損餉之弊。畢自嚴(yán)言：“相沿已久，難于核實(shí)。請(qǐng)無(wú)論軍種民種，一照民田起科?！背绲澔实凼瞧渥h。先是，魏忠賢亂政，邊餉多缺，畢自嚴(yán)給發(fā)如期。又疏言：“最耗財(cái)者無(wú)如客餉。諸鎮(zhèn)年例合三百二十七萬(wàn)，而客餉居三之一，宜大裁省。其次則有撫賞、召買、修筑諸費(fèi)，皆不可不節(jié)?！背绲澔实郯{之。

    福建海盜猖蹶，崇禎皇帝又提拔熊文燦為右僉都御史，巡撫福建，讓他去招降海盜頭目鄭芝龍；熊文燦出生于萬(wàn)歷三年（公元一千五百七十五年），正是在他出生的這一年里，常年出海的福建籍水手們將煙草從菲律賓帶到福建種植，這一年也成為中國(guó)煙草種植元年，當(dāng)時(shí)人是這樣記載的：“此物自古未聞也，近自我明萬(wàn)歷時(shí)始出于閩、廣之間，自后吳、楚皆種植之矣?！备＝ㄖ袩煘榧o(jì)念此事，還專門出了一種香煙品牌—土樓1575。

    熊文燦出生于四川瀘州市瀘縣，萬(wàn)歷三十五年（公元一千零七年）中進(jìn)士，授貴州推官，遷禮部主事，歷郎中。出封琉球還，擢山東左參政、山西按察使、山東右布政使。憂歸，自是徙家蘄水。

    崇禎元年，起福建左布政使。三月，就拜右僉都御史，巡撫其地。海上故多劇盜，袁進(jìn)、李忠既降，楊六、楊七及鄭芝龍繼起。總兵官俞咨皋招楊六、楊七降，鄭芝龍猖獗如故。然鄭芝龍嘗敗都司洪先春，釋不追；獲一游擊，不殺；俞咨皋戰(zhàn)敗，縱之走。當(dāng)事知其可撫，遣使諭降之。熊文燦至，善遇鄭芝龍，使為己用。

    鄭芝龍又名鄭一官，出生于萬(wàn)歷三十二年（公元一千六百零四年），出生在福建南安石井（閩南漁村），鄭一官?gòu)男【蛯?duì)海事感興趣，，性情逸蕩，不喜讀書(shū)，有膂力，好拳棒，跅弛放縱，漸流蕩逸，失父愛(ài)。

    鄭一官生長(zhǎng)到十六、七歲時(shí)，因少年落魄，偕其弟鄭芝虎、鄭芝豹前往澳門，依附舅父黃程；當(dāng)時(shí)，黃程是個(gè)從事海外貿(mào)易的海商，鄭一官就留在黃程身邊幫助協(xié)助商務(wù)；在黃程的影響下，鄭一官走遍東南亞各地，逐漸學(xué)會(huì)了怎樣進(jìn)行商業(yè)競(jìng)爭(zhēng)、追逐海外利益；鄭一官還學(xué)會(huì)了葡萄牙文，為方便與葡萄牙人打交道中，鄭一官遂取教名賈斯帕（nis），另名尼古拉，葡萄牙人都叫他尼古拉?一官（nichos iquan）。

    黃程與東洋人有貿(mào)易往來(lái)，見(jiàn)鄭一官如此能干，天啟三年（公元一千六百二十三年）譴其附日本華僑李旦之舶，押送一批白糖、麝香、鹿皮等貨物；李旦為旅日華僑的領(lǐng)袖，擁有一支專門從事大明、日本海外貿(mào)易的船隊(duì)，鄭一官于是投入他的門下，并得到李旦的重用，當(dāng)時(shí)，居日華僑，咸推重鄭一官，此時(shí)的鄭一官已公認(rèn)是繼李旦之后的華僑領(lǐng)?。

    鄭一官自幼年起，就喜歡“舞刀弄?jiǎng)Α?，在日本期間認(rèn)識(shí)了為幕府將軍鍛刀劍的泉州冶工翁老，又通過(guò)翁老的介紹，得以在駿府（今靜岡縣）晉謁當(dāng)時(shí)已退隱的幕府將軍德川秀忠，德川秀忠是個(gè)中國(guó)通，他向鄭一官問(wèn)起中國(guó)事，鄭一官口齒清楚、“對(duì)答如流”，德川秀忠欣喜之余在長(zhǎng)崎賓館招待鄭一官，賜賚頗為優(yōu)渥。