可就在這時，北方的俄羅斯國漸漸強盛起來，他們在滿清剛剛興起的時候，派了遠征軍，越過外興安嶺，侵占黑龍江北岸。這時清兵正忙著入關(guān)，無暇顧及，俄羅斯將領(lǐng)喀巴羅帶了幾百個俄兵，又將黑龍江北岸的雅克薩侵占了去，并且用土筑城，派兵駐守。這還不止，俄軍又分路沿著黑龍江繼續(xù)往下，被清都統(tǒng)明安達禮和沙爾呼達先后擊退，只是雅克薩依然被他占據(jù)。
　　康熙二十一年的時候，三藩相繼削平，康熙便想將侵入境內(nèi)的俄羅斯人驅(qū)逐出去，先派了副都統(tǒng)郎坦，以打獵為名，渡過黑龍江偵察雅克薩的地理形勢。不久，郎坦回來報告說，俄軍兵力不多，容易掃除?？滴跤谑菦Q定驅(qū)逐俄羅斯，并先命令戶部尚書伊桑阿，到寧古塔負責監(jiān)造大船。又修筑了墨爾根、齊齊哈爾兩座城市，增添了十個驛站，以便打起仗來水陸聯(lián)運軍糧。接著，又派遣薩布素為黑龍江將軍，籌劃戰(zhàn)備，同時讓蒙古的車臣汗斷絕了與俄羅斯的貿(mào)易。
　　康熙二十二年，俄羅斯一名叫模里尼克的將軍，率領(lǐng)六十多名哥薩克兵，從雅克薩城出發(fā)，到達黑龍江下游時，正好遇到清朝的巡邏船，六十多哥薩克兵全部被捉。模里尼克也被捉住，送到齊齊哈爾關(guān)了起來。
　　康熙二十三年，清兵到雅克薩城勸降，俄軍拒不投降。
　　康熙二十四年，清都統(tǒng)彭春率領(lǐng)水陸兩軍北征，其中陸軍大約就有一萬人，并隨帶巨型大炮兩百門，水軍五千人，戰(zhàn)艦一百余艘，從松花江進入黑龍江，黑壓壓地聚到雅克薩城下。俄將軍托爾布津決定死守雅克薩，但其手下僅有四百多兵力。彭春命令他把土城讓出來，帶兵回國去。托爾布津仗著勇猛善戰(zhàn)，不肯服從。清兵于是用大炮轟城，托爾布津開城迎戰(zhàn)，氣焰十分囂張。一番混戰(zhàn)之后，俄軍敗北，只得放棄所占土地，退到尼布楚。彭春于是命令士兵將土城搗毀，率兵凱旋。
　　誰知到了第二年，托爾布津又與陸軍大佐伯伊頓一起，再度到了雅克薩，并且重新筑起了土壘，駐兵守衛(wèi)。彭春又帶兵八千人，運了大炮四百門前去進攻。托爾布津命令伯伊頓守住土壘，自己率領(lǐng)部下拼命死戰(zhàn)，他手下只有四百多人，前次傷亡了幾十名，現(xiàn)在只剩下了三百多人，卻能與八千清兵往來沖突。清兵圍住這邊，他們沖到那邊，待圍住那邊，他又溜到這邊。折騰一陣，彭春焦躁起來，下令讓部下開炮，那托爾布津還不顧死活，竟然沖上來要奪取炮具。只聽得轟的一聲，托爾布津中了炮彈倒在地上，俄軍這才逃回他們筑起的土壘中。
　　伯伊頓的部下也只有一兩百人，這些人與托爾布津手下的殘兵，一起死守土壘。清兵用大炮轟擊土壘，他便挖了地洞躲避炮彈，炮彈來了就藏進去，炮彈一停又鉆出來，土壘一有破損，馬上就修補好。
　　這段時期，正好從荷蘭來清朝貢的使者也在京城，自稱與俄羅斯相鄰，愿意充當居間調(diào)停人。康熙于是讓荷蘭使臣送信到俄國，信中譴責俄國無故侵略邊境地區(qū)。不久得到俄國皇帝大彼得的回信，大約是說中俄文字不通而導致了沖突，現(xiàn)在已經(jīng)了解到是因為邊境上的人挑釁所致，所以將派使臣到邊境劃定界線，但是請求先解除雅克薩的包圍。