萬歷四十八年九月初一，朱常洛在吃了兩枚仙丹后正式成仙了。
　　早上群臣進(jìn)乾清宮哭過先皇后，提出要將朱由校請到文華殿，大家一起叩頭拜見未來的皇帝。李選侍不放心，要他們就在乾清宮拜見就行了。兵科左給事中楊漣叫來已升為司禮監(jiān)秉筆太監(jiān)的王安，要他將太子請出來。
　　王安進(jìn)去對李選侍說：“乾清宮有二位先帝靈柩，不宜拜見太子，所以外臣想在文華殿里給太子叩頭，叩完頭就送回乾清宮?！崩钸x侍就要李進(jìn)忠?guī)±钚∴囈黄鹋闾尤?，吩咐要小心照顧好太子?br/>　　朱由校出來以后，大學(xué)士方從哲、劉一燝、韓爌，吏部尚書周嘉謨，戶部尚書李汝華，兵科左給事中楊漣，署禮科事刑科給事中暴謙，浙江道御史左光斗一擁而上，把朱由校嚇了一跳。李進(jìn)忠急忙護(hù)住太子，楊漣沖上去，一把推開他，一個耳光扇了過去，罵道：“你個閹人滾到一邊去?！崩钸M(jìn)忠不敢回嘴，更不敢還手，只好捂著通紅的臉跟著一起走，楊漣又道：“你們不要跟著來，再過來打斷你們的腿。”李進(jìn)忠等人只好眼睜睜地看著太子被帶走，轉(zhuǎn)身回去稟告李選侍。
　　其實(shí)，朱由校不是被帶走，而是被架走，腳不沾地地到了文華殿。大家請?zhí)由献?，一起叩頭如儀。楊漣請?zhí)釉缋^皇帝位，以安天下心。朱由校說道：“先皇仙去，孤心中悲痛，只想悼念先皇，不欲繼皇帝位。”
　　皇帝繼位，都是需要正式的三請三辭才行的，所以這樣的請求太子不允許本來就是意料中事，然后大臣們又稟告了一些喪事的安排，這些事完了后大臣們行禮準(zhǔn)備退去，這時楊漣發(fā)話了：“太子不能回乾清宮，應(yīng)該重新找一個地方安置太子?！笔纵o方從哲道：“先皇登基以來，太子都是隨居于乾清宮，為何不能回？”
　　楊漣道：“乾清宮內(nèi)尚有李選侍在，太子年幼，易受其蠱惑，如其欲行垂簾之事，那我們能怎么辦？應(yīng)該將李先侍從太子身邊調(diào)天，這樣才能讓人放心。”
　　方從哲心想，以李選侍身份地位，想行垂簾之事，那是絕無可能，但又不好反駁，于是問道：“不回乾清宮那讓太子住在哪里呢？”
　　王安欠身說道：“慈慶宮為原太子宮，可為太子暫居之所?！?br/>　　楊漣道：“那就慈慶宮吧?！眱扇似灾徽Z就決定了這件事，根本沒有征求首輔的意見，方從哲臉色不變，一言不發(fā)。
　　整個過程中，也沒有一個人問過朱由校想住在哪里，商量的時候，看都沒有看他。眾人擁著他到了慈慶宮，行禮告別而去，王安叫來幾個太監(jiān)，吩咐他們仔細(xì)伺候著太子，也離開了。
　　象個木偶一樣被群臣無視，朱由校心里的惱怒可想而知。等王安走了以后，他直接走出慈慶宮，回到乾清宮，幾個太監(jiān)勸太子不要離開，朱由校理都不理，又不敢攔著太子，只能跟在他身后，直到他進(jìn)了乾清宮，才無奈地回去。
　　一進(jìn)宮來，李選侍和客氏迎了上來。李選侍道：“他們可曾為難哥兒了?！?br/>　　朱由校說道：“他們當(dāng)然不會為難我，媞媞呢，我餓了，一起吃飯吧?！敝劣谒麄儾幌胱约夯厍鍖m的事，還是別說了，免得李選侍煩惱，客氏擔(dān)心。
　　吃飯以后，照例是守靈。朱由校坐在靈堂里開始思考，按照常理，太子年幼，本來就要有人照顧才行，而現(xiàn)在大臣們卻要讓他獨(dú)居在慈慶宮，遠(yuǎn)離自己熟悉的人，這事有點(diǎn)反常呀？
　　按照平行時空管理局一號所說，自己應(yīng)該在這一年當(dāng)上皇帝，看這情形，大概就是這幾天的事情。而自己一個才十六歲虛歲的小孩子，大臣們在面對他時雖然在叩頭，但根本看不出有什么恭謹(jǐn)之心，那么他們讓自己獨(dú)居的目的就昭然若揭了：他們想孤立他，想讓自己做他們的傀儡。
　　根據(jù)跳得越歡得利越大的原則分析，方從哲顯然不是這么想的，那這么想的就應(yīng)該是楊漣那一伙人。自己初來乍到，人生地不熟的，可不能上了他們的當(dāng)，方從哲應(yīng)該可以拉過來做盟友，徐光啟那更是不用說，不是盟友而應(yīng)該是心腹，還有誰？朱由校悲催地發(fā)現(xiàn)，外廷自己根本沒有可用之人。
　　外廷不行，那宮內(nèi)呢？第一個可以信任的當(dāng)然是李進(jìn)忠了，還有王體乾呀，李朝欽呀都是不錯的，王安好象和楊漣走得比較近，還是小心一點(diǎn)為妙。
　　第二天，群臣來到慈慶宮拜見太子，不想?yún)s人去樓空，楊漣立即叫人把王安找來，王安聽慈慶宮太監(jiān)說明了情況，立刻叫人將慈慶宮的太監(jiān)按在地上狠打，邊打邊罵：“為什么昨天晚上不去告訴我？”眾臣也不管王安懲罰太監(jiān)的事，先去了文華殿，王安則又來到乾清宮，要請?zhí)尤ノ娜A殿。
　　朱由校道：“有什么事，就在乾清宮說吧?！彼刹幌胂笞蛱煲粯樱屓肆糇』夭粊?。王安道：“今日群臣有大事啟奏，乾清宮有兩位先帝靈柩。諸事不便，所以請?zhí)尤ノ娜A殿，然后再回宮來?！?br/>　　朱由?；氐溃骸安槐亓?，就在這里說吧，有什么事不能在這里說嗎？”
　　李選侍卻起了疑心，問道：“怎么了，昨天不是也在文華殿嗎？哥兒為什么今天不去了？”
　　朱由校昨天沒有對她說實(shí)話，所以今天也就不大好回答這個問題，心想，大不了晚上再回來唄。于是辭別了李選侍等人，跟著王安去了文華殿。
　　群臣跪拜以后，禮科左給事中李若圭上奏說，冊封大禮舉行是有一定的次序的。孝端顯皇后（神宗皇后）、孝靖皇后（光宗生母）尊謚還沒有行封，郭元妃（光宗元配）、王才人（朱由校生母）應(yīng)該封為皇后的事連尊號都還沒有定好，冊封選侍李氏為貴妃的事暫宜停止，禮部尚書孫如游也說按禮來說應(yīng)該如此。朱由校知道最后只能是這個結(jié)果，只好答應(yīng)了。