洪承疇來到永寧后，他先拜見了巡撫朱燮元，宣了皇帝密旨，然后與秦良玉和魯欽交換了意見，借了部分白桿兵和近衛(wèi)軍后，就開始干活了。
　　他先將關押著的土司及頭目們進行甄別，大家相互檢舉揭發(fā)，然后把被迫加入叛亂的集中在一起，明確告訴他們，如果想回家，就要讓家中出錢來贖罪。當然，根據加入叛軍時間長短和造孽的多少，出的贖金數目當然也是不同的。
　　至于主動投誠或者與官軍暗通款曲的土司或頭目，則給予嘉獎，也是根據投誠的時間來論功行賞。最后的那些死硬分子，則宣布于明日午時，一起斬首示眾，并要求所有土司及頭目必須要在現(xiàn)場觀看。
　　這一天在永寧最寬大的街道上，搭起了一個大臺子，臺子周圍站立著幾十個近衛(wèi)軍步兵，火銃都上好了子彈，而臺子旁邊的房間里和街道兩頭更是布滿了步兵，以防有人借機生事。
　　午時三刻到，洪承疇先宣讀圣旨：“皇帝詔曰：永寧宣撫司奢賊崇明，不思皇恩，妄殺天朝官吏，攻占重慶，對抗天兵。爾等助紂為虐，辱我邊民，殺我邊兵。普天之下，莫非王土，特諭各地軍民，凡有參與奢賊造反者，皆斬其首，夷其三族，抄其家產。欽此?！?br/>　　殺氣騰騰的圣旨宣完后，洪承疇下令開斬，每一次提上臺二十個人，劊子手手起刀落，一顆顆頭顱飛上天空，然后落在木板上，滾了幾下后，終于靜止不動，那張開到極致的雙目，似乎在言說自己的悔恨或者不甘。
　　二十人殺完再換二十個人上來。一千多人一共殺了快兩個時辰，換了幾茬劊子手才殺完。濃烈的血腥味充斥在街道上，臺子旁邊觀禮的土司們看得面色慘白，有些人屎尿齊流，更有人被嚇得暈了過去。連一直主張殺人的魯欽都不忍再看下去，只有洪承疇面色如常，還有滋有味地品著當地的香茗。等人殺完后，他陰沉著臉看著眾土司道：“爾等當引以為戒?！闭f完轉身離去。
　　幾天后，洪承疇查明了大明官吏們盤剝土司土兵情況，他多年在刑部任職，這種事對他來說不要太簡單，然后根據官吏行為的程度，分別給予斬首，下獄，抄家等不同的懲罰。依舊是在前幾天的大臺子上，殺了一批官吏，那些陪殺的官吏表現(xiàn)得比土司更為不堪，幾乎是個個失禁。而那些旁觀的土民則是大聲叫好。
　　然后由朱燮元宣旨：廢除永寧宣撫司，永寧地方設立道府治理，任命洪承疇為永寧知府。這兩場殺戮，第一場將土人嚇住，第二場則出了土人心中的一口氣，使得永寧的人心迅速地安定了下來，朱燮元再派出流官的過程就很順利了。相信在洪承疇的血腥手段下，流官們應該也是不大敢再激怒土民的了，而大量土司及頭目被殺，不但使土民組織不起來，也使得當地人談知府色變，一動也不敢亂動。
　　魯欽在給皇帝的奏折中，大大將洪承疇贊揚了一番，其中有一句話是這樣寫的：“臣以為論到殺伐果斷，唯有孫傳庭可與之相比?！敝煊尚？戳撕螅瑢⑦@句話念給近衛(wèi)軍眾將聽，并嗤笑道：“不就是說他們兩個是屠夫嗎！魯欽說得自己好象很仁慈似的，他殺的人比孫洪兩人加起來都要多得多，戰(zhàn)場上殺人和刑場上殺人其實沒有區(qū)別，殺人只是手段，達到了目的就可以了，你們在戰(zhàn)場上以后要記住這一點，不要把手段當成了目的?！北妼⒍键c頭稱是。