華人士兵侵襲騷擾當(dāng)?shù)鼐用癫皇桥既皇录?，在李明遠(yuǎn)的嚴(yán)厲命令下，相繼發(fā)現(xiàn)五六起華人士兵違反軍紀(jì)事件。
　　隨著調(diào)查的深入，發(fā)現(xiàn)吸食鴉片的華人士兵有一千多人，而違反軍紀(jì)的士兵幾乎全部有吸食鴉片和其他的惡劣行為。
　　一支強(qiáng)大軍隊的塑造需要花費幾年時間，而混入部隊中的害蟲則很容易侵蝕軍隊的戰(zhàn)斗力，毀掉一支部隊。
　　千里之堤，毀于蟻穴，對于違反軍紀(jì)的士兵，李明遠(yuǎn)沒有心慈手軟，指示劉樸按照軍法審理，該殺頭的殺頭，該懲罰的懲罰。
　　三天之內(nèi)，被查出的一千三百名華人士兵有二百人被判處死刑。其他人等分別被判處不同年限的勞動改造。
　　審判決定出來后，很多部隊里的軍官找到劉樸求情，請求對這些士兵從輕發(fā)落?？墒菂s被劉樸一句“審判決議已經(jīng)交由世子過目”打發(fā)走。
　　李明遠(yuǎn)治軍嚴(yán)厲，而且劉樸的審判是以軍法為依據(jù)。如果他們敢向李明遠(yuǎn)求情，肯定沒有好果子吃，因此，求情的軍官一個個偃旗息鼓，回去提醒手下士兵嚴(yán)格遵守軍紀(jì)，不要落在劉樸手里。
　　一次判處兩百多士兵死刑確實有些嚴(yán)厲，可是為了整頓部隊風(fēng)氣，殺雞儆猴，李明遠(yuǎn)不得不這樣做。
　　不加甄別地強(qiáng)迫華工加入軍隊，在華工面臨生死存亡的時候是不得已的選擇。
　　殲滅秘魯南部主力軍隊，和秘魯總統(tǒng)佩德羅達(dá)成交易后，李明遠(yuǎn)已經(jīng)認(rèn)識到，
　　一支充斥著不同人等的部隊存在的缺點，那就是在部隊勝利的時候，整支隊伍可以凝聚為一個整體，
　　可是一旦遇到強(qiáng)大的敵人，隊伍很可能因為人心紛雜而分崩離析。
　　為了解決部隊存在的問題，一個月前，李明遠(yuǎn)把部隊重新編組，整編后的野戰(zhàn)軍作為華人獨立軍的核心力量，戰(zhàn)斗力稍遜一籌的士兵則劃歸警備軍指揮。
　　令李明遠(yuǎn)欣慰的是，這次被抓獲的士兵絕大部分是警備軍和后勤部隊的士兵，野戰(zhàn)軍只有五六個士兵因為喝酒耽擱了訓(xùn)練被罰，這起碼證明了前段時間的部隊整編是成功的，編組起來的野戰(zhàn)軍士兵軍紀(jì)比警備軍強(qiáng)的多。
　　華人獨立軍現(xiàn)行的軍法沿襲太平軍軍法，對于很多士兵違反軍紀(jì)的問題界定不清，所以遇到不好判決的士兵違法問題，劉樸還要親自向李明遠(yuǎn)請教。
　　“劉樸，現(xiàn)在的軍法漏洞和不合理的地方不少。你看這一條：士兵頂撞上官，當(dāng)眾鞭刑十次?！碧幚硗晔勘`法問題，李明遠(yuǎn)向劉樸指出一處軍法的不合理處。
　　“世子，軍隊之中上下等級分明，士兵頂撞上官施行鞭刑算不了嚴(yán)厲的處罰。以前在天國時，士兵頂撞上官還有直接被判處死刑?！?br/>　　封建軍隊中，隨意體罰打殺士兵的現(xiàn)象很常見，李明遠(yuǎn)要打造的是一支近代化的軍隊，所以必須要廢除落后的封建軍法。
　　“劉樸，我們的眼光要放長遠(yuǎn)一些，
　　現(xiàn)在不是以前國內(nèi)混戰(zhàn)爭奪天下的時候，西方列強(qiáng)軍事工業(yè)發(fā)展迅速，封建式的滿清軍隊在面對西方列強(qiáng)時不堪一擊，我們也要吸取教訓(xùn)，不光要在武器裝備上追趕西方列強(qiáng)軍隊，在部隊管理上也要向他們學(xué)習(xí)，