鳳翔節(jié)度使李茂貞的軍隊(duì)占領(lǐng)興元（漢中市）后，他又請(qǐng)求擔(dān)任山南西道節(jié)度使，鎮(zhèn)守興元府。唐昭宗同意了，任命李茂貞為山南西道兼武定節(jié)度使，并且割出果州、閬州隸屬武定節(jié)度使管轄。

    但朝廷又委任中書侍郎、同平章事徐彥若擔(dān)任鳳翔節(jié)度使。李茂貞想同時(shí)占有鳳翔、興元兩個(gè)地方，因而拒不奉行詔令。

    李茂貞比較強(qiáng)橫，給唐昭宗寫的表章態(tài)度很不好，唐昭宗生氣，想要派兵討伐李茂貞。

    李茂貞知道后，又寫了一個(gè)表章說：“陛下身為大唐皇帝，卻不能保護(hù)舅舅王瑰的性命，也殺不了楊復(fù)恭這個(gè)叛賊。朝廷對(duì)待各藩鎮(zhèn)，只看各節(jié)度使的實(shí)力強(qiáng)弱，從來不管節(jié)度使做的事情是否有道理。勢(shì)力弱的節(jié)度使如果犯錯(cuò)誤，朝廷就會(huì)懲罰，而勢(shì)力強(qiáng)的如果犯錯(cuò)誤，朝廷反而通過恩賞進(jìn)行拉攏。長此以往，京城四周的百姓會(huì)遭受禍害，皇上就是逃難恐怕也找不到合適的地方！”

    唐昭宗對(duì)這樣的說辭更加憤怒，決心討伐李茂貞，命令宰相杜讓能負(fù)責(zé)征討事宜。

    杜讓能卻說：“陛下剛即位不久，國家還不太平，鳳翔的李茂貞離京師長安這樣近，不應(yīng)當(dāng)與他結(jié)仇，萬一不能取勝，朝廷后悔也來不及了?！?br/>
    唐昭宗回復(fù)說：“朕不想做軟弱的君主，現(xiàn)在皇室的地位越來越低，號(hào)令難出長安，我咽不下這口氣。你為朕調(diào)動(dòng)軍隊(duì)糧食，朕親自派親王統(tǒng)領(lǐng)軍隊(duì)，即使戰(zhàn)敗也不會(huì)追究你的過錯(cuò)?！?br/>
    杜讓能還想抗拒，但唐昭宗說：“你身為宰相，不要推諉扯皮，要與朕同甘共苦。”杜讓能流淚說：“只是現(xiàn)在的形勢(shì)不好，不是我不奉行詔令，只是擔(dān)心又朝一日臣會(huì)像晃錯(cuò)一樣遭受殺戮，我只能以死相報(bào)朝廷了！”

    杜讓能在中書省為了戰(zhàn)爭做準(zhǔn)備，一個(gè)多月沒有回家。

    但另一位宰相崔昭緯陰險(xiǎn)狡詐，內(nèi)結(jié)宦官，外通藩鎮(zhèn)，暗地里與邠寧軍、岐山軍通信息，杜讓能早晨說的一句話，這兩個(gè)州晚上就會(huì)知道。

    鳳翔鎮(zhèn)岐山軍的李茂貞得知后，指使他的黨羽糾集很多人，向觀軍容使西門君遂告狀說：“李茂貞沒有罪，不應(yīng)當(dāng)對(duì)他進(jìn)行征討，以免百姓遭受戰(zhàn)禍。”

    西門君遂說：“這是宰相的事，不是我管的。”于是，那些人又?jǐn)r住宰相崔昭緯、鄭延昌乘坐的轎子告狀。

    這兩位宰相也說：“皇帝專門委任太尉杜讓能負(fù)責(zé)此事，我們事先也不知道。”百姓一氣之下，亂投磚瓦石塊，崔昭緯、鄭延昌慌忙下了轎子躲藏起來，據(jù)說官印和上朝服裝都丟失了。

    唐昭宗要求捉拿發(fā)起這次鬧事的人，并且殺死，再次要求出兵討伐。長安的百姓因害怕，有的逃到山谷中藏匿起來。

    893年八月，唐昭宗任命覃王李嗣周為京西招討使，神策大將軍李鐬（huì）擔(dān)任副使。

    九月十日，覃王李嗣周率領(lǐng)三萬名禁軍，護(hù)送新任的風(fēng)翔節(jié)度使徐彥若前往鳳翔赴任鎮(zhèn)所，軍隊(duì)駐扎在興平縣。

    鳳翔軍李茂貞、邠寧軍王行瑜聯(lián)合起來，與官軍抗拒，共出兵六萬人，駐扎在周至縣。

    但朝廷禁軍都是剛召募來的青少年，都不會(huì)打仗，而李茂貞、王行瑜所帶領(lǐng)的都是戍邊軍士，都經(jīng)歷過大大小小上百次的戰(zhàn)斗，戰(zhàn)斗力較強(qiáng)。

    九月十七日，李茂貞等軍隊(duì)逼近興平，朝廷禁軍竟然不戰(zhàn)而逃。李茂貞等乘勝進(jìn)攻東進(jìn)，直逼長安西邊的三橋，長安震驚。

    士紳和百姓都四處逃走，很多百姓聚集到皇宮門前，請(qǐng)求誅殺提議發(fā)兵征伐的人。

    崔昭緯故意陷害宰相杜讓能，給李茂貞送信說：“朝延用兵并不是皇帝的意思，都是太尉杜讓能出的主意。”

    十九日這天，李茂貞把軍隊(duì)陳列在長安城西的臨皋驛，向唐昭宗進(jìn)呈表章，歷數(shù)杜讓能的罪行，請(qǐng)求殺死他。

    杜讓能此時(shí)無奈的對(duì)唐昭宗說：“我本來就有預(yù)料，現(xiàn)在就請(qǐng)通過懲處我解除戰(zhàn)爭?！?br/>
    唐昭宗此時(shí)不說大話了，哭著說：“朕對(duì)不住你了，只能與你分別！”當(dāng)天，就把杜讓能貶為梧州刺史。

    唐昭宗又把觀軍容使西門君遂流放到儋州，內(nèi)樞密使李周潼流放到崖州，段詡流放到歡州。

    第二天，唐昭宗親臨安福門，下令把西門君遂、李周潼、段詡處斬，把杜讓能再次貶為雷州司戶。。

    朝廷又派使臣對(duì)李茂貞說：“蠱惑朕出兵的，是西門君遂、李周潼和段詡?cè)?，不是杜讓能的罪過，朕已將他流放貶官了。”

    隨后，朝廷任命宦官駱全瓘和劉景宣分別擔(dān)任左、右神策軍中尉。