到了正月13日，明太宗燕武親王：朱棣，在行過大祀天地從南郊?xì)w來之時，文武群臣們開始行慶成禮，由明禮部尚書：李至剛，帶頭提出改北平行都指揮使司為〈北京〉、改應(yīng)天府皇城為〈南京〉，還故意編造出理由道“自古帝王，或以布衣平定天下，或繇外藩入承大統(tǒng)，而于肇跡之地皆有升崇，今見北平承宣布政使司，乃陛下承運龍興之地，宜遵太祖高皇帝設(shè)中都留守司之制立為京都。”此奏當(dāng)即就被允諾下來。
2月初3日明太宗又設(shè)置了北京留守行后軍都督府、北京邢部、北京國子監(jiān)，并改北平府為〈順天府〉，北平行太仆寺為（北京行太仆寺），以及行都督府還設(shè)置了左右都指揮使、都指揮同知、都指揮僉事等無定員。
邢部則設(shè)置尚書二人、侍郎四人，六曹吏戶禮兵刑工，各設(shè)有；郎中、員外郎、主事一人，還改明戶部尚書：郭資、明刑部尚書：雒僉，兩人為〈北京邢部尚書〉。
2月12日因之前北元益宗烏薩哈爾汗天元帝：孛兒只斤·脫古思帖木兒，被乞兒吉斯部首領(lǐng)兀雷帖木兒汗：烏格齊·鬼力赤，殺害！而乞兒吉斯鬼并非元帝后裔，導(dǎo)致各部落多不服氣，又遭到北元恭宗興原帝：孛兒只斤·恩克卓里克圖（也速迭爾）放棄大元皇帝稱號，改稱〈韃靼〉自稱大汗，明太宗得知事情后立即遣使給乞兒吉斯首領(lǐng)以通好，并賜與銀幣等物件。
早在明洪武四年公元1371年，大明帝國就在原吐蕃等處宣慰司設(shè)置了烏斯藏衛(wèi)指揮使司、朵甘衛(wèi)指揮使司以及宜慰使司元帥府、招討司、萬戶府、守御千戶所等行政機構(gòu)。
明洪武七年公元1374年起開始升朵甘衛(wèi)指揮使司、烏斯藏衛(wèi)指揮使司二衛(wèi)為〈都指揮司〉等到明太宗登基稱帝后，聽說烏斯藏行都指揮使司僧人：哈立麻，精通道術(shù)善于幻化，被稱為「尚師」，很想往征一晤。
隨后明永樂元年公元1403年2月18日，明太宗派遣了明司禮監(jiān)少監(jiān)：侯顯，同僧人：智先一道，帶著書幣出使陜西行都司、烏斯藏行都指揮使司，以征召尚師：哈立麻，并挑選壯士健馬護行。
到京師之后明太宗詔命明駙馬都尉：沐昕，出迎并在奉天殿內(nèi)親自接見尚師，賜領(lǐng)天下釋教，明司禮監(jiān)少監(jiān)因奉使有功被擢封為〈司禮監(jiān)秉筆太監(jiān)〉奉詔出使周邊各國。
明太宗還讓明翰林院大學(xué)士：解縉，負(fù)責(zé)編寫〈永樂大典〉總裁，以及修編〈明太祖實錄〉、〈列女傳〉等書籍。
3月初5日因念及兀良哈三衛(wèi)扶持自己登基有功，故此特意把大寧都指揮使司所轄地區(qū)全部割讓給兀良哈三衛(wèi)作為回報，并調(diào)營州左屯衛(wèi)、營州右屯衛(wèi)、營州前屯衛(wèi)、營州后屯衛(wèi)、營州中屯衛(wèi)和東勝左衛(wèi)、東勝右衛(wèi)至內(nèi)地，并改北平行都指揮使司為大寧都指揮使司，還把大寧都指揮使司所轄都司府內(nèi)遷至保定府境內(nèi)，至此遼東都指揮使司和宣府左衛(wèi)、宣府右衛(wèi)、宣府前衛(wèi)之間的聲援隔絕，算是間接的削弱了大明帝國北部的防御能力。
然而在遼東都指揮使司關(guān)外的女真三大部落；建州八部、海西女真部、東海女真部(野人女真)自從女真斡朵里部首領(lǐng)萬戶侯：愛新覺羅·孟穆特（猛哥帖木兒）被明帝國天子分封為朝廷官員之外，在加上朝廷經(jīng)常派遣使臣前關(guān)外四處招撫還往東海女真部宣諭，才使得不斷有女真部落首領(lǐng)率眾入山海衛(wèi)進(jìn)關(guān)來朝。
11月12日明太宗親自接見了來朝的女真胡里改部首領(lǐng)：阿哈出，等人，再加上女真胡里改部首領(lǐng)幫助大明帝國招撫了東海女真部一些小部落首領(lǐng)，故此被明太宗在女真胡里改部正式設(shè)置了〈建州衛(wèi)軍民指揮使司〉任命阿哈出為衛(wèi)指揮使，娶其女為嬪妃，還賜老丈人漢姓「李思誠」。
其余部族人則被委任為千戶、百戶、衛(wèi)鎮(zhèn)撫、總旗、小旗、千總、把總等官職，賜給誥印、冠帶，還設(shè)置了建州衛(wèi)經(jīng)歷司，從此大明帝國在女真族地區(qū)開始了大規(guī)模的設(shè)置衛(wèi)所機構(gòu)。
明永樂二年公元1404年正月19日，明太宗親自下令禁止民間海船下海，原有海船全部改為平頭船，所在地方設(shè)有（備御千戶所）防止其私自出海，依舊有福建承宣布政使司塘縣沿海居民私載海船出海遠(yuǎn)行西洋貿(mào)易，因而為浪人或者賊寇，所轄地區(qū)州府縣官員如實奏報朝廷處理。
2月有苦兀女真部首領(lǐng)：把刺答哈，忽剌溫兀者首領(lǐng)：阿剌孫，腦溫部首領(lǐng)：古驢，等人來朝進(jìn)貢，明太宗一高興便設(shè)置了〈奴兒干衛(wèi)〉管理此處，并以把刺答哈為奴兒干衛(wèi)指揮使、阿剌孫為奴兒干衛(wèi)指揮僉事，古驢為奴兒干衛(wèi)鎮(zhèn)撫，并賜以誥印、冠帶、襲衣及鈔幣等，以此說明黑龍江下游地區(qū)歸入大明帝國版圖。
之后明太宗又在斡難河、黑龍江流域的南北地區(qū)以及松花江、烏蘇里江、格林河、恒滾河等流域先后設(shè)置了120個衛(wèi)、10個守御千戶所，進(jìn)一步加強了對該地區(qū)的統(tǒng)治。
11月因為明太宗在直沽縣為海運商船往來要地位置十分重要，故此設(shè)立〈衛(wèi)〉筑城，而自己也曾是在這里起兵南下的，為了紀(jì)念「靖難之役」的勝利，明太宗賜名為〈天津衛(wèi)〉意謂著此地乃是天子經(jīng)由之渡口。
故此設(shè)置天津衛(wèi)碼頭巡司屯守直沽縣，由于海運只能抵達(dá)直沽縣，再用小船運至北京，故命在天津衛(wèi)置露屯一千四百所，用來儲蓄物品。
12月又設(shè)置了天津左衛(wèi)碼頭巡司。
之后又派遣使臣去陜西行都指揮使司封原駐守在哈密力的北元肅親王：孛兒只斤·安克帖木兒，為大明忠順郡王，又設(shè)置哈密衛(wèi)管理此地。
在明永樂三年公元1405年6月15日明太宗派明司禮太監(jiān)：鄭和，帶著27800人乘座62艘寶船下西洋，第一次遠(yuǎn)航大明船隊對外宣布天子恩惠安撫邊邦諸國，而西洋諸國也都派遣使者去朝見大明皇帝。
在途經(jīng)麻喏八歇國（滿者伯夷國王：維克拉馬法哈納）時，因為該國有戰(zhàn)亂分東、西二王經(jīng)?；ハ嘟粦?zhàn)，待明軍們經(jīng)過之際西王不知情誤以為是東王幫兇，故此派人半路劫殺前隊大明寶船登岸人員，事件發(fā)生之后西王得知真相立即就派了使者前來謝罪，明司禮監(jiān)太監(jiān)看在西王主動請罪受罰，以及不知情的份上對該事件予以了克制和原諒。
之后在三佛齊國時遇到了搶劫商旅的渤林邦國酋長：陳祖義，他見大明寶船上財貨眾多就打起了小算盤，計劃用詐降計攻打明軍船只在殺人奪貨。
此等計謀自然是瞞不過身經(jīng)百戰(zhàn)的明司禮監(jiān)太監(jiān)的，因為他不是宮里面只會佞言的無能太監(jiān)，而是足智多謀的文人軍師，結(jié)果可想而知等他們靠近大明寶船之后，明軍不僅沒混亂反而還以〈布雷船〉用火攻打敗渤林邦海盜軍并活捉渤林邦國王獻(xiàn)給明太宗，當(dāng)即就被朝廷下令斬首，并在渤林邦國境內(nèi)設(shè)立「舊港宣慰使司」來管理此地。
同時琉球山南國王：承察度、中山國王：察度、山北國王：帕尼芝，三王來朝分別被明太宗賜以冠帶、詔書與〈尚姓〉。
明永樂四年公元1406年因附屬國安南輔政太師：胡季犛，謀害陳順宗：陳颙，和陳少宗：陳安，徹底滅亡安南陳朝，建立起了安南胡朝改國號為〈大虞〉自稱「國祖章皇」但是并不敢叫（朕）而是叫（矛）后來在陳朝舊臣們的反對下以及害怕大明才讓位給二子開天皇：胡漢蒼（他有陳朝宗室血統(tǒng)）故此得到大臣們擁戴。
11月15日明禮部郎中：夏止善，奉詔前往安南國，賜封安南開天皇：胡查（黎漢蒼）為安南國王還遣使謝恩也得到明太宗的承認(rèn)。
之后安南國先攻打占城國，兩軍交戰(zhàn)之際占軍節(jié)節(jié)敗退，不得已上奏請求大明帝國派兵支援，而明使來調(diào)解過后安南國同意歸還占城國土，可此時又遇陳朝家奴：阮康，謊稱是陳朝后裔：陳天平，要朝見明太宗告訴實情，最后明太宗派遣明廣西都指揮僉事：黃中，帶領(lǐng)5千明軍護送陳天平回安南國。
但是途中卻被安南左相國：胡元澄，斬因此明太宗大怒命明新成侯兼征夷大將軍：張輔、明平西侯兼左副將：沐晟，帶領(lǐng)20萬明軍南下鎮(zhèn)壓安南國，而安南胡朝方面派了7萬胡軍號稱〈百萬大軍〉對戰(zhàn)明軍。
經(jīng)過二年時間明軍徹底攻滅胡朝，明太宗在此地設(shè)立了〈交趾承宣布政使司〉并把安南左相國帶回去應(yīng)天府內(nèi)關(guān)押，本以為他會一輩子坐牢，卻沒想到因為會制作火器而被明太宗釋放賜封他為（工部左侍郎）又拜為工部尚書，負(fù)責(zé)獻(xiàn)上；交趾神銃、木神銃、霹靂火球、引火球、毒藥煙球，等作戰(zhàn)使用的火器成為明軍主要軍事武器。
使得交趾承宣布政使司與剛封的大明西域哈密衛(wèi)忠順郡王一起被納入大明疆域，并在緬甸宣慰使司境內(nèi)增設(shè)底兀剌宣慰使司、大古刺宣慰使司、底馬撒宣慰使司。
明永樂五年公元1407年明司禮監(jiān)太監(jiān)再次奉命出發(fā)南下西洋，訪問了占城國、暹羅國、爪哇國、蘇門答剌國，又往天竺洋駛?cè)?，以柯枝國和古里國為目的地，大明使臣在古里國正式冊封古里王為大明帝國附屬國，并在古里國刻立石碑以紀(jì)念這一盛事。
但到錫蘭國之時大明船隊登陸之后，就向有關(guān)佛寺布施了金、銀、絲絹、香油等物品，正因如此當(dāng)即遭到了錫蘭國王：阿羅伽拘那羅五世：亞烈苦奈爾（錫蘭西南部僧訶羅王國權(quán)臣）的惦記，他先是送信交好把明司禮監(jiān)太監(jiān)誘騙到島上。