清軍入關(guān)后，雖然鎮(zhèn)壓了聲勢(shì)浩大的農(nóng)民軍和東南、西南以及其他各地的抗清力量，建立了全國的封建統(tǒng)治，但實(shí)際上在康熙初期，南方尚有“三藩割據(jù)”，東南海上鄭成功的子孫還占據(jù)著臺(tái)灣，西北邊疆蒙古準(zhǔn)噶爾部也未臣服。康熙為了實(shí)現(xiàn)全國統(tǒng)一，不得不進(jìn)行“南征北戰(zhàn)”。

    “三藩”，是指鎮(zhèn)守云南的平西王吳三桂、鎮(zhèn)守福建的靖南王耿精忠和鎮(zhèn)守廣東的平南王尚可喜之子尚之信。他們割據(jù)一方，并不斷向外發(fā)展，嚴(yán)重威脅著清朝政府的統(tǒng)治。1673年，康熙以尚可喜奏請(qǐng)歸老遼東為機(jī)緣，開始撤藩。撤藩令一下，吳三桂即于當(dāng)年十一月在云南發(fā)動(dòng)暴亂?？滴跏?1674年)初，吳三桂率軍攻入湖南，平南王的女婿廣西將軍孫延齡、靖南王耿精忠先后響應(yīng)。隨后，云貴、四川、湖廣、閩粵、甘陜等地握有重兵的清軍提鎮(zhèn)大員也紛紛豎起叛旗。清朝廷采用打擊與安撫相結(jié)合的辦法，最后于康熙二十年(1681年)十月，平定了歷時(shí)八年之久的“三藩”之亂。

    “三藩”之亂平定之后，統(tǒng)一臺(tái)灣成為清政府必須解決的問題?？滴醵?1681年)，清朝廷派大將姚啟圣、施瑯進(jìn)攻臺(tái)灣?？滴醵觊c六月，施瑯攻下澎湖，據(jù)守臺(tái)灣的鄭成功的孫子鄭克爽投降。八月，清軍勝利進(jìn)駐臺(tái)灣。第二年，清政府在臺(tái)灣設(shè)立一府(臺(tái)灣府)三縣(臺(tái)灣、鳳山、諸羅)，隸屬于福建省，從而使臺(tái)灣歸入中國的版圖。

    康熙初年，居住在天山北路的蒙古族中的厄魯特準(zhǔn)噶爾部的封建大地主噶爾丹合并了其他三部，占據(jù)了天山南路各城。1690年，噶爾丹在沙俄支持下，率兵向內(nèi)蒙古進(jìn)攻?？滴醯蹫榱司S護(hù)國家的統(tǒng)一，鞏固自己的統(tǒng)治，先后三次親自帶兵出征，1690年，大敗噶爾丹于烏蘭布通。噶爾丹在清兵的追擊下，于1697年敗死。后來，其侄子策妄阿拉布坦又發(fā)動(dòng)叛亂，康熙帝1720年再次帶兵出征，平定了叛軍。1757年，乾隆帝又派兵平定了準(zhǔn)噶爾貴族阿睦爾撒納的叛亂。至此，準(zhǔn)噶爾部才終于臣服。清政府設(shè)立了伊犁將軍、參贊大臣等，率兵分駐伊犁、塔城等地，加強(qiáng)了對(duì)天山北路的統(tǒng)治。

    雍正五年(1727年)，清政府在西藏設(shè)置駐藏大臣，以監(jiān)督西藏地方事務(wù)。乾隆五十七年(1792年)，英國殖民者唆使尼泊爾封建主入侵西藏，被清政府擊敗。清政府對(duì)西藏的政治、經(jīng)濟(jì)、軍事進(jìn)行了一系列的重大改革，使西藏地區(qū)與中央政府之間的關(guān)系更加密切。

    在少數(shù)民族眾多的西南地區(qū)，清政府于1726年至1731年間，實(shí)行了“改土歸流”的政策，即由朝廷直接派遣的流官代替原來由少數(shù)民族世襲的土司，從而削弱了土司的勢(shì)力，消除了這些地區(qū)的割據(jù)狀態(tài)，加強(qiáng)了統(tǒng)治。

    1757年，南疆回部首領(lǐng)大、小和卓木煽動(dòng)維吾爾族貴族發(fā)動(dòng)叛亂。在各族人民的幫助下，清政府于1759年粉碎了這次叛亂活動(dòng)，制定措施加強(qiáng)和鞏固對(duì)天山南路的統(tǒng)治。1820年，大和卓木的孫子張格爾在英國侵略者的唆使下，率叛軍竄入天山南路各城，要恢復(fù)對(duì)“回疆”的統(tǒng)治。1827年，清軍在維吾爾族人民的支持下，收復(fù)叛軍，并俘獲了張格爾，收復(fù)了天山南路各城，恢復(fù)了祖國的統(tǒng)一。

    經(jīng)過一系列征戰(zhàn)之后，清政府實(shí)現(xiàn)了國家的真正統(tǒng)一。清朝前期，我國的疆域西達(dá)蔥嶺和巴爾喀什湖，北接西伯利亞，東到太平洋，南面包括南沙群島。當(dāng)時(shí)，生活在統(tǒng)一的封建國家內(nèi)部的民族成員有漢、滿、蒙古、回、藏、維吾爾、壯、苗等50幾個(gè)民族。統(tǒng)一的多民族國家的建立，加強(qiáng)了各族人民間經(jīng)濟(jì)和文化的聯(lián)系，促進(jìn)了邊疆地區(qū)的開發(fā)。