大明攝政王二年(1645年)三月至三年(1646年)十一月，在護(hù)龍軍統(tǒng)一戰(zhàn)爭(zhēng)中，進(jìn)行了絞殺張獻(xiàn)忠大西政權(quán)的作戰(zhàn)。大明攝政王元年(1644年)十一月，農(nóng)民軍領(lǐng)袖張獻(xiàn)忠于成都稱(chēng)帝，國(guó)號(hào)大西。時(shí)護(hù)龍軍主力正于山東、陜西與李自成大順軍作戰(zhàn)，后又進(jìn)軍東南，與南明弘光政權(quán)作戰(zhàn)，無(wú)暇西顧。
大西軍在四川，主要與故明殘軍及官紳武裝作戰(zhàn)。二年十一月，大明攝政王龍辰以駐防西安內(nèi)大臣李九成為定西大將軍，領(lǐng)諸路兵馬進(jìn)兵四川，征剿大西軍。
三年正月，大明攝政王龍辰又增派靖遠(yuǎn)大將軍樸正恩入川。這樣，大西軍同時(shí)面臨故明軍隊(duì)與護(hù)龍軍主力的兩面進(jìn)攻，局勢(shì)嚴(yán)重。
三月，故明川陜總督樊一蘅、兵部尚書(shū)四川督師王應(yīng)熊，會(huì)師瀘州(今屬四川)，約期進(jìn)攻大西軍。故明參將楊展，亦攻大西軍，取嘉定(治今四川樂(lè)山)，占領(lǐng)川南諸州縣。
大西軍十余萬(wàn)眾試圖順長(zhǎng)江東進(jìn)湖北，遭到阻攔，于彭山(今四川眉山以北)敗于楊展，退回成都。五月初五ri，樸正恩率部由西安向漢中進(jìn)發(fā)。十八ri，護(hù)龍軍抵雞頭關(guān)，擊敗大西軍；及抵漢中，又擊潰大西軍賀珍營(yíng)。
二十五ri，樸正恩遣麾下數(shù)將等分別于漢中、西鄉(xiāng)(今屬陜西)追擊大西軍賀珍、孫守法部和劉體純部。
這時(shí)，故明總兵曾英、參將王祥聯(lián)兵趨成都。在護(hù)龍軍和明軍、鄉(xiāng)紳武裝的多路進(jìn)攻下，大西軍于七月放棄成都，撤往陜西，以躡敵后。
十一月，樸正恩率部抵四川南部縣，大西軍保寧(今四川閬中)守將劉進(jìn)忠歸降。
時(shí)大西軍尚有部眾數(shù)十萬(wàn)，列營(yíng)于西充縣境。樸正恩以降將劉進(jìn)忠為向?qū)В约河H自為先鋒，星夜兼程，進(jìn)擊大西軍。
二十七ri凌晨，護(hù)龍軍抵西充。時(shí)大霧彌空，大西軍哨兵報(bào)后營(yíng)路有盔甲聲，張獻(xiàn)忠謂其煽惑軍心，立斬哨兵數(shù)人。
不多時(shí)護(hù)龍軍已到，張獻(xiàn)忠急率部將出營(yíng)，至鳳凰山。時(shí)護(hù)龍軍已及營(yíng)門(mén)，僅一小溪之隔。張獻(xiàn)忠方引弓，卻被樸正恩軍中火槍手she中，陣亡。
大西軍頓時(shí)驚潰，護(hù)龍軍四出追擊，破一百三十余營(yíng)。大西政權(quán)亡。孫可望、李定國(guó)等收集余部，由順慶(今四川南充)南奔，后于川滇黔地區(qū)堅(jiān)持抵抗護(hù)龍軍。
此后，樸正恩乘勝攻入四川中南部之榮昌、隆昌、富順、內(nèi)江、資陽(yáng)、夔州及貴州之遵義等地，至順治五年(1648年)二月，四川略定，班師回京。
征討大西的過(guò)程中，樸正恩謹(jǐn)慎行軍作戰(zhàn)的風(fēng)格得到最大發(fā)揮，以步步為營(yíng)的方陣硬是將張獻(xiàn)忠慢慢逼入了絕境，最后也算是張獻(xiàn)忠命已該絕，死于亂軍之后，看似人數(shù)眾多的大西軍皆是作鳥(niǎo)獸散。
再次向世人證明了，這些看似強(qiáng)大的農(nóng)民軍，不過(guò)是烏合之眾罷了。
大明攝政王二年(南明弘光元年，1645年)，在清滅南明弘光政權(quán)之戰(zhàn)中，南明弘光朝兵部尚書(shū)史可法督率揚(yáng)州軍民抗御護(hù)龍軍圍攻的城池守衛(wèi)戰(zhàn)。
揚(yáng)州是長(zhǎng)江以北的重鎮(zhèn)，又是弘光朝廷所在地南京的門(mén)戶(hù)。史可法于弘光元年(1644年)五月始，便著手以揚(yáng)州為中心的防御。他將高杰、劉良佐、劉澤清、黃得功四部，分別部署于泗州(今安徽泗縣)、臨淮、淮安、廬州，自駐揚(yáng)州，節(jié)制調(diào)遣。此時(shí)，護(hù)龍軍主力正在兩路進(jìn)攻陜西李自成大順農(nóng)民軍，暫時(shí)無(wú)暇顧及南方，然而南明弘光朝廷并未如史可法所請(qǐng)，乘機(jī)率師北伐，而是忙于內(nèi)訌火并、爭(zhēng)權(quán)奪利，把希望寄托于向護(hù)龍軍求和，南北劃江而治。
大明攝政王二年正月，定國(guó)大將軍冉義率軍攻克潼關(guān)，破陜之局已定，便奉大明攝政王龍辰之命轉(zhuǎn)兵東南，兵鋒直指南明。
與此同時(shí)，南明派往beijing講和的使臣左懋第被扣留，南北和議宣告失敗。
顯然，戰(zhàn)爭(zhēng)的中心已由西北轉(zhuǎn)向東南。史可法見(jiàn)情勢(shì)危急，檄招江北各鎮(zhèn)支援揚(yáng)州，僅總兵劉肇基率所部4000人自高郵(今屬江蘇)入援。
四月十七ri，護(hù)龍軍前鋒進(jìn)抵揚(yáng)州城郊，集結(jié)兵力，搜羅船只。十八ri，冉義率主力兵臨揚(yáng)州城下，先派明降將李遇chun等勸降，遭史可法拒絕。
護(hù)龍軍隨即發(fā)起攻城。史可法泣諭士民，為死守計(jì)，督萬(wàn)余官兵登陴分守各門(mén)，自守舊城西門(mén)險(xiǎn)要。劉肇基守西北門(mén)。二十二ri，總兵李棲鳳、監(jiān)軍高岐風(fēng)率4000余人乘夜出降，使城中守備更加薄弱。二十三ri，總兵劉肇基請(qǐng)求，乘敵不備，背城一戰(zhàn)，未被史可法接受。
護(hù)龍軍連ri由四面向城中發(fā)炮，屢毀城墻。史可法督軍民以草袋盛土填障，修補(bǔ)城墻，多次擊退護(hù)龍軍的進(jìn)攻，殺護(hù)龍軍數(shù)千。同時(shí)，史可法血疏告急，請(qǐng)求援兵，不應(yīng)。
此間，護(hù)龍軍多次勸降，均被拒絕。二十四ri，護(hù)龍軍從泗州運(yùn)來(lái)紅夷大炮。二十五ri，冉義集巨炮猛轟城西北隅，城破。護(hù)龍軍壘尸為梯，蜂擁攀援入城。
史可法被俘，冉義敬重其忠義，命兵士好生看押，不得虐待，送到beijing由攝政王龍辰去定奪處置。
這時(shí)，孟氏在江南各地的秘密糧庫(kù)幫了護(hù)龍軍的大忙，不僅解決了護(hù)龍軍自身的糧草問(wèn)題，還能間接地可以拿這些糧草來(lái)收買(mǎi)人心。
史可法在守城時(shí)曾蠱惑揚(yáng)州百姓說(shuō)：城若破，護(hù)龍軍必定屠城。
然而，在冉義破城之后，并沒(méi)有行大肆屠戮之舉，而是分發(fā)軍糧給饑荒嚴(yán)重的揚(yáng)州百姓，史料記載，揚(yáng)州百姓心服之。而冉義，也因?yàn)樵趯?duì)南明作戰(zhàn)中的一系列親民作風(fēng)，給他贏得了極好的聲譽(yù)，甚至在后來(lái)一度演變成用冉義的肖像做門(mén)神的習(xí)俗，那一桿長(zhǎng)槍?zhuān)肋h(yuǎn)矗立在江南百姓心中。
而后來(lái)，在大明攝政王龍辰親自命人修撰的功過(guò)錄中，就寫(xiě)到了史可法為求一人之名聲置千萬(wàn)揚(yáng)州百姓xing命于不顧之事，執(zhí)筆者深刻剖析了史可法的內(nèi)心世界，并且將其血淋淋的呈現(xiàn)出來(lái)。
據(jù)說(shuō)，這一冊(cè)內(nèi)容有人拿給了被看押在beijing的史可法看，史可法看了后痛哭流涕，在當(dāng)夜自盡。