皇甫規(guī)自辭官歸隱安定后，諸部羌人紛紛派人前來(lái)拜訪，贈(zèng)以重禮，皇甫規(guī)與其妻馬氏一一退回，皇甫規(guī)之名更是響徹西涼諸郡，各郡才俊登門拜訪者絡(luò)繹不絕，如漢陽(yáng)人閻忠、金城人邊章，皆是當(dāng)時(shí)西涼俊杰。
卻也招致護(hù)羌校尉段颎不滿，新怨舊恨相加一起，段颎接連上奏桓帝，舉報(bào)皇甫規(guī)勾連羌人，廣布威望，收攬人心，其心有異。桓帝接到奏報(bào)后，連番下詔斥責(zé)皇甫規(guī)，言辭激烈，皇甫規(guī)未免懼怕，先是向段颎請(qǐng)罪賠禮，而后又向桓帝訴明其中曲直，桓帝與段颎這才作罷。
皇甫規(guī)未免再生事端，只得終日閉門謝客，潛心致學(xué)，卻也免不得時(shí)常唉聲嘆氣。其妻馬氏出生扶風(fēng)馬家，乃皇甫規(guī)繼室，一手草書聞名遐邇，為當(dāng)時(shí)才女，甚得贊譽(yù)。馬氏早已從族兄馬日磾處聽聞洛陽(yáng)之事，心中知曉皇甫規(guī)有所不甘，勸慰道：“老爺，今番業(yè)已離京，不必日夜擔(dān)驚受怕，得償所愿，安生度日才是，何必再橫生枝節(jié)，徒增煩惱?！?br/>
“唉”，皇甫規(guī)嘆息一聲，緩緩開口道：“夫人有所不知，我皇甫規(guī)一生自負(fù)文武雙全，自幼立志建不世之功，揚(yáng)名天下，辭官避居，亦是不得已而為之；如今雖垂垂老矣，昔日抱負(fù)尚存于胸，怎奈時(shí)不與我，空有一身才干，卻無(wú)處施展，難免心中一時(shí)落寞。”
馬氏看著皇甫規(guī)郁郁寡歡，言語(yǔ)凄涼，低頭不語(yǔ)，心中哀憐油然而生。馬氏想起自己與皇甫規(guī)年歲相差甚大，奈何家中長(zhǎng)輩為結(jié)好當(dāng)時(shí)威名赫赫的皇甫規(guī)，強(qiáng)拉硬拽，將自己嫁于皇甫規(guī)續(xù)弦，本來(lái)心中尚有幾絲幽怨；然而相處時(shí)日一長(zhǎng)，發(fā)覺皇甫規(guī)文武兼?zhèn)?，并非世人口中的“西涼武夫”，不僅通曉兵事，且深諳兵、儒、道等多家學(xué)術(shù)經(jīng)典，心中敬服，那幾絲幽怨早已隨風(fēng)而去。
“依妾身之見，老爺既胸懷抱負(fù)，又一心為國(guó)，與其落寞閑居，聊度一生，倒不如于西涼開館授徒，將一生才華授予后起之秀，亦可借機(jī)教化西涼羌人，減免戰(zhàn)禍，造福天下百姓，舒緩心中不暢”，馬氏見皇甫規(guī)終日無(wú)所事事，于府中哀怨自憐，出言勸道。
皇甫規(guī)思慮半晌，關(guān)東士人向來(lái)看輕西涼才俊，只知“西涼大馬，橫行天下”，卻不曉涼州才俊飽受欺凌鄙夷，于朝堂上煢煢孤立，若是在西涼傳授儒家大道，對(duì)祛除涼州人粗狂彪悍之氣，大為有益，點(diǎn)頭道：“夫人所言有理，我自入朝為官以來(lái)，堅(jiān)信我西涼文士絲毫不亞于關(guān)東士卿，只不過地處偏遠(yuǎn)，又民風(fēng)剽悍，羌人作亂，故而世人對(duì)我西涼人士頗有誤解，若是能借開館授學(xué)，教化百姓，亦是有益于子孫百姓，此事大有可為。”
“老爺身兼數(shù)家之長(zhǎng)，定可教化良才，為國(guó)培育棟梁之才”，馬氏見皇甫規(guī)面色舒緩，展顏一笑。
皇甫規(guī)忽而又眉頭緊鎖，擔(dān)憂道：“昔日李膺也曾廣授門生，引得陛下猜忌，若是我于西涼授學(xué)之事，為陛下所知，恐陛下心中又是不悅?！?br/>
馬氏想起桓帝如此對(duì)待皇甫規(guī)，滿心不忿，說(shuō)道：“扶風(fēng)馬氏與安定皇甫氏素來(lái)名動(dòng)西涼，何況老爺問心無(wú)愧，若是一味退讓，只會(huì)讓群小越發(fā)猖獗，肆意誣陷，老爺不可再退縮，免得他人以為皇甫家好欺。”
“好，明日我便于安定設(shè)立堂館，授學(xué)傳道，看他等還能如何”，皇甫規(guī)沉聲說(shuō)道。
當(dāng)夜，皇甫規(guī)想起馬日磾甚是贊賞侄兒皇甫嵩（字義真）有韜略，多番舉薦皇甫嵩入朝為將，而如今朝堂混亂，自己不愿皇甫嵩入朝為官，便召來(lái)其皇甫嵩，將開設(shè)學(xué)館之事告知，又悉心叮囑道：“義真我知你心中不甘平庸，只是叔父擔(dān)憂如今朝堂不寧，風(fēng)聲鶴唳，故而不愿你入朝為將，何況張奐、段颎、李膺等皆是名將，尚存于世，效力于朝，不如待日后我等故去，朝廷用人之際，再出仕為官不遲?！?br/>
皇甫嵩知曉皇甫規(guī)辭官歸隱是為避禍，可是自己苦學(xué)兵法，怎愿就此平淡度日，幾度張口欲言，終還是不敢違背皇甫規(guī)之意。
“叔父知你有將才，卻不能施展一身才華，心中憋屈，只是你資歷尚淺，且心浮氣躁，若你今番應(yīng)召入朝，鋒芒太露，必然惹得陛下更為猜忌皇甫家，閹宦亦會(huì)趁機(jī)誣陷，皇甫一門便在劫難逃，倒不如潛心致學(xué)，磨礪品性，伺機(jī)而發(fā)”，皇甫規(guī)笑道。
皇甫嵩這才臉色舒緩，想起皇甫規(guī)令其子棄武從文，又是猜測(cè)道：“叔父令兄長(zhǎng)不沾刀兵，深習(xí)儒道，莫非也是為避免天子猜忌？”
“不錯(cuò)，叔父不僅知曉兵事，也對(duì)古今學(xué)說(shuō)多有涉及，故而讓你兄弟二人一學(xué)文，一習(xí)武，日后你二人也可互補(bǔ)兼容”，皇甫規(guī)見皇甫嵩問起，便如實(shí)相告。
皇甫嵩自與皇甫規(guī)夜談之后，終日在家埋頭苦讀兵書，閑暇之際，時(shí)常閱覽黃老學(xué)術(shù)，以求修身養(yǎng)性，戒驕戒躁。而皇甫規(guī)也在涼州開設(shè)學(xué)館，以《詩(shī)》、《易》教授門徒，并完善荀子學(xué)說(shuō)，于當(dāng)時(shí)率先提出‘百姓是水，君主為舟’的思想，以此警醒世人。直至皇甫規(guī)去世，皇甫學(xué)館才廢棄，然皇甫學(xué)館共歷經(jīng)十四載，門生不下千人。
后大涼定鼎立國(guó)，重開皇甫學(xué)館，改名涼州學(xué)館，學(xué)生中多有能文善武者，且忠心耿耿，為涼國(guó)歷代帝王所倚重。
是年夏末，京師及上黨地震，而后勃海海水倒灌，黃河泛濫成災(zāi)，沿河郡縣受災(zāi)嚴(yán)重，桓帝下令州郡自行賑災(zāi)，府庫(kù)錢糧一律封存不動(dòng)。
士人儒生以為海水倒灌，乃是逆反之兆，可見朝中有奸佞當(dāng)?shù)?，紛紛出言斥罵宦官一黨，朝臣多有上書彈劾宦官者，如陳蕃、劉瑜等人。
桓帝惱怒交加，陳蕃卻是倚老賣老，不顧桓帝訓(xùn)斥，又是奏道：“陛下，黃河泛濫成災(zāi)，饑民饑寒交迫，皆因朝綱不振，宦官作祟，老臣叩請(qǐng)陛下懲辦奸人，賑濟(jì)百姓，減免賦役，休養(yǎng)生息?！?br/>
“如今邊疆異族屢屢為禍，你等不知為朕分憂也罷，反而終日于朝堂之上興風(fēng)作浪，以致朝堂紛爭(zhēng)不休，何況國(guó)庫(kù)錢糧乃是朕辛苦籌措，日后用來(lái)平定東羌之用，決不可擅動(dòng)”，桓帝聽得陳蕃等人上奏開國(guó)庫(kù)賑濟(jì)百姓，頓時(shí)大怒，對(duì)群臣一番斥責(zé)。
這時(shí)樊陵上奏道：“陛下可還記得去歲黃河變清，士人儒生紛紛牽強(qiáng)附會(huì)，以河水變清為由，妄言亂政，誣陷朝臣?！?br/>
“嗯，此事朕自然記得，真是樹欲靜而風(fēng)不止，朝堂不寧，朕如何安定邊疆”，桓帝苦澀道。
樊陵繼而乞求道：“陛下所言甚是，前番黃河清澈，士人多有言宦官作祟，當(dāng)時(shí)臣便有言，此非天降異象，乃黃河將生水災(zāi)之兆；而今黃河成災(zāi)，臣以為賑濟(jì)饑民，只可得一時(shí)之安，治標(biāo)不治本，當(dāng)籌集錢糧，修繕河堤，疏浚河道，以杜絕水災(zāi)之禍，功在當(dāng)代，利在千秋，后世之人亦會(huì)對(duì)陛下感恩戴德?！?br/>
桓帝聞聽撥款治河，臉色頓時(shí)冰冷如霜，不悅道：“黃河水災(zāi)自古就有，若想根治談何容易，耗費(fèi)之巨難以想象，如今國(guó)庫(kù)錢糧另有他用，何況沿岸百姓早已習(xí)慣水災(zāi)，忍耐一時(shí)便可，不必如此大興土木，勞民傷財(cái)?！?br/>
樊陵一聽桓帝這話，另有深意，心知肚明，桓帝要留著國(guó)庫(kù)余財(cái)去平定東羌，畢竟天下大事，都有取舍，點(diǎn)頭道：“陛下英明，東羌屢次侵入三輔，關(guān)中不安，不可不除，臣方才失察之言，還請(qǐng)陛下贖罪?！?br/>
“嗯！念你忠心敢言，只此一次，下不為例，至于治理黃河之事，待日后平定異族后，朕自會(huì)考慮”，桓帝對(duì)樊陵知情識(shí)趣、謙卑恭敬，很是滿意。
先是地震，繼而水災(zāi)，朝臣士人借機(jī)大加劾奏宦官，邊疆異族如骨刺在喉，桓帝為此煩悶不快，以致病情加重。宦官見此，暗中指使州郡官吏，假稱天降祥瑞，以愉悅桓帝。
秋八月，巴郡報(bào)稱黃龍現(xiàn)，西河報(bào)稱白兔來(lái)，魏郡報(bào)稱嘉禾生、甘露降，種種虛無(wú)，無(wú)一不是諂言獻(xiàn)媚，取悅上心，一時(shí)間各地祥瑞連連，桓帝龍顏大悅。
其中，以巴郡黃龍之說(shuō)，最為荒誕，據(jù)報(bào)當(dāng)時(shí)一群青年在池塘游戲，忽而見池塘水波蕩漾，渾濁不堪，紛紛戲言恐嚇道：“水中有黃龍。”豈料一句戲言，卻引得鄉(xiāng)間百姓交口相傳，一傳十，十傳百，巴郡太守聞知此事，當(dāng)即秉承宦官囑托，上奏朝廷，并在塘邊興建黃龍廟，以保大漢永盛不衰。
桓帝對(duì)此大加贊賞，卻有郡府屬吏北地郡人傅堅(jiān)上奏言明實(shí)情，稱黃龍之說(shuō)乃是差役百姓戲言，不可當(dāng)真。傅堅(jiān)此舉惹得宦官記恨，桓帝亦是不悅，詔責(zé)巴郡太守將傅堅(jiān)鞭笞四十，以儆效尤。自此，朝中大臣再無(wú)敢言祥瑞虛妄，紛紛漠然不語(yǔ)，宦官得而越發(fā)驕縱橫行。