《尼布楚條約》訂立之時(shí)，悄然間，外蒙古已經(jīng)被來(lái)自新疆的準(zhǔn)噶爾部落的首領(lǐng)噶爾丹占領(lǐng)。正是因?yàn)檫@個(gè)原因，中國(guó)和俄國(guó)的邊界其實(shí)劃到了尼布楚為界，而尼布楚以西的地方，尤其是有關(guān)外蒙古與西伯利亞之間的界限并沒(méi)有談?wù)摰健?br/>
    當(dāng)時(shí)在外蒙古的蒙古人，分成了三個(gè)部分：首先是東邊的車臣汗國(guó)、其次是西邊的札薩克圖汗國(guó)、最后是中間的土謝圖汗國(guó)。三個(gè)汗國(guó)的汗，都是來(lái)自于當(dāng)年元太祖忽必烈的十六世孫的后裔，加在一起統(tǒng)稱為“漠北”或“漠北喀爾喀”。而在熱河的東部，其實(shí)也有喀爾喀，分成左右兩部分。

    新疆北部的蒙古人在元朝分為四個(gè)衛(wèi)拉特（oirat），而準(zhǔn)噶爾在今天的伊犁地區(qū)，和碩特在烏魯木齊一帶，杜爾伯特在承化一帶，土爾扈特在塔城附近的雅爾一帶。

    明代的官方文書(shū)稱衛(wèi)拉特為“瓦剌”，到了清朝的時(shí)候，便稱呼為“厄魯特”或“額魯特”。

    準(zhǔn)噶爾在四個(gè)衛(wèi)拉特里是最為強(qiáng)勢(shì)的，甚至在明朝末年，強(qiáng)迫土爾扈特部遷走，讓他們到俄國(guó)境內(nèi)伏爾加河流域（直到乾隆年間才遷了回來(lái)）。

    準(zhǔn)噶爾本就強(qiáng)勢(shì)，而在康熙年間準(zhǔn)部出現(xiàn)了一位很有能力的領(lǐng)袖——噶爾丹。他吞并了和碩特部與杜爾伯特部，一舉統(tǒng)一了新疆的北部，又用武力讓新疆南邊的喀爾噶爾、葉爾羌等回教部落也歸屬了他。

    康熙二十七年，他又利用札薩克圖汗部與土謝圖汗部的“內(nèi)訌”與矛盾，趁機(jī)領(lǐng)了三萬(wàn)騎兵，幫札部打土部，打敗了土部又占領(lǐng)札部，倒是有幾分像假虢滅涂之計(jì)，之后又侵占了車臣汗部。從此，噶爾丹成為事實(shí)上草原的霸主，跨有外蒙古和新疆，好似當(dāng)年努爾哈赤之崛起于遼東一樣，但地盤(pán)比努爾哈赤的發(fā)源可要大得多。

    眾所周知，康熙也是一位雄才的君主，他怎么能忍受這樣的威脅，任何有點(diǎn)腦子的統(tǒng)治者都不會(huì)允許自己的政權(quán)旁邊還有另外一個(gè)強(qiáng)大的地盤(pán)，再不濟(jì)也得有個(gè)緩沖地帶，正如趙匡胤所言“臥榻之畔豈容他人鼾睡”。

    正好這個(gè)時(shí)候，三個(gè)“漠北喀爾喀”汗部的汗以及臣民集體逃難到沙漠的南邊，人數(shù)有幾十萬(wàn)之眾?？滴醣硎練g迎，并且把他們安置在蘇尼特各旗的地方。

    噶爾丹逼迫的很緊，一直在后面緊追。以感性的評(píng)價(jià)維度，噶爾丹此刻以后，死不足惜。

    康熙覺(jué)得此刻時(shí)機(jī)已到，決定親征。

    在出了長(zhǎng)城以后，駐扎在博和洛屯，將主要的兵力交由同父異母的裕親王福全，封為撫遠(yuǎn)大將軍，迎擊噶爾丹。

    兩軍在烏蘭布通一起相遇，八月初一，噶爾丹把駱駝捆了，蓋著浸透水的毯子，形成所謂的“駝陣”，卻怎么也擋不住清的槍炮，噶爾丹大敗。

    噶爾丹派代表伊拉古克三呼圖克圖來(lái)和清軍的福全談判議和，他的要求是：交出土謝圖汗部的汗察琿多爾濟(jì)以及建議漠北喀爾喀諸部向南逃難的哲布尊丹巴（活佛）。福全覺(jué)得條件太過(guò)于苛刻，不允通過(guò)，將伊拉古克三呼圖克圖罵走。

    結(jié)果剛過(guò)一天，噶爾丹又派了一位叫濟(jì)隆的呼圖克圖來(lái)，說(shuō)道：噶爾丹不再要求交出察琿多爾濟(jì)，只需要將哲布尊丹巴交出，并押送給西藏的達(dá)賴?yán)锛右詰土P，便可以了。

    福全的意思是他這個(gè)級(jí)別沒(méi)有資格答應(yīng)，要先請(qǐng)示康熙后，才可有消息。還說(shuō)：你必須要保證在等候消息的時(shí)間內(nèi)，噶爾丹不允許跑到其他地方去，劫掠我的臣民。濟(jì)隆表示可以保證。

    福全一面向康熙報(bào)告，一面派侍衛(wèi)陪著濟(jì)隆去見(jiàn)噶爾丹，要他在“威靈佛”前跪下磕頭宣誓。宣誓結(jié)束以后，噶爾丹又派伊拉古克三過(guò)來(lái)，交給了濟(jì)隆一份給康熙的奏章，上面要康熙原諒自己的罪，并要求允許自己“出邊待命”?？滴跖鷾?zhǔn)了，但告訴福全“噶爾丹為人狡詐，仍當(dāng)防備他。”而這個(gè)時(shí)候，噶爾丹已經(jīng)真的出了邊。

    十月的時(shí)候，福全借口糧食太少，將軍隊(duì)撤退到了哈瑪爾嶺?？滴醮笈J(rèn)為軍隊(duì)不可妄動(dòng)，下旨讓福全回北京，索性將全部的軍隊(duì)都撤回?？滴趺饬烁Ｈ白h政大臣”的職務(wù)，罰俸三年，削奪了三個(gè)佐領(lǐng)（九百個(gè)世仆及耕地牛羊）

    第二年五月，康熙在多倫回見(jiàn)蒙古逐部落首領(lǐng)，將“漠北”（外蒙古）編為三十七個(gè)旗，與內(nèi)蒙的四十九旗同樣看待，每個(gè)旗都設(shè)世襲的“札薩克”。這樣的措施和木蘭秋彌很是相像，將滿洲貴族與蒙古的聯(lián)系溝通日益密切，也是為了政權(quán)的穩(wěn)定而考慮做出的滿蒙聯(lián)合方針。

    過(guò)了兩年（康熙三十二年），康熙打算派人送漠北喀爾喀的人回到原地，結(jié)果科爾沁的奏章說(shuō)噶爾丹約他們一起南侵。康熙停止了送漠北喀爾喀人回原地的舉措，準(zhǔn)備再次和噶爾丹碰一碰。

    康熙三十五年三月，再次下旨親征，自己領(lǐng)著中路軍，長(zhǎng)驅(qū)直入到達(dá)達(dá)克魯倫河的附近，噶爾丹在河對(duì)面，還沒(méi)開(kāi)始打，就已經(jīng)害怕西撤了，康熙在兩天以后才知道對(duì)方跑了。

    噶爾丹退到了昭莫多地方，與清的西路軍相遇。恰逢這時(shí)，綠營(yíng)的士兵將噶爾丹的后隊(duì)輜重劫了，把噶爾丹殺的大敗而退，自己的“可敦”（王后）阿弩也戰(zhàn)死。

    噶爾丹這個(gè)時(shí)候最想回到新疆去，結(jié)果消息傳來(lái)，自己的侄子兼仇人策妄阿拉布坦，已經(jīng)接受了康熙的命令，回到伊犁。屋漏偏逢連夜雨，噶爾丹派自己的兩個(gè)兒子去哈密，結(jié)果哈密的回王捆了直接交給了清軍。

    噶爾丹在窮途末路之下，于康熙三十六年喝毒藥自殺。

    康熙三十七年，康熙第三次親征，駐扎榆林，噶爾丹的部下把他的尸體和女兒及三百戶殘余人口，送還清軍。

    康熙這才安心，下詔班師回京。

    漠北喀爾喀的幾十萬(wàn)人口被送回，三十七個(gè)旗也擴(kuò)張至五十五個(gè)旗。又增設(shè)一個(gè)賽音諾顏部，冊(cè)封額附（駙馬）策凌為第一代的貝勒（諾顏），統(tǒng)轄十九個(gè)旗，從此之后外蒙共擁有七十四旗（到了乾隆年間，增加至八十三旗）。