金門海戰(zhàn)之后，齊王王爭(zhēng)針對(duì)眼下齊軍各部紛雜的弊端，開啟了一次規(guī)模浩大的全軍整改。
　　
　　首先，王爭(zhēng)取消了戰(zhàn)兵的編制，組建南京禁軍，定額十萬(wàn)，分五大營(yíng)，除了原本尖刀、振武、玄武、奮威四營(yíng)以外，增設(shè)揚(yáng)威營(yíng)。
　　
　　這次陸軍的改革許多人希望已久，這次放出五個(gè)珍貴的將軍號(hào)，原本四位戰(zhàn)兵系大將除了分任禁軍主將以外，都將得到屬于自己的將軍號(hào)，敘為齊軍諸將前列。
　　
　　董有銀仍任尖刀營(yíng)主將，為昭勇將軍；黃陽(yáng)仍任玄武營(yíng)主將，為昭威將軍；鄧黑子任振威營(yíng)主將，為光武將軍；高亮經(jīng)過(guò)外甥風(fēng)波之后，仍然被王爭(zhēng)委任為奮威營(yíng)主將，封光毅將軍。
　　
　　禁軍除了用以列陣攻堅(jiān)的五大營(yíng)之外，還設(shè)有輜重營(yíng)、驍騎營(yíng)、火器營(yíng)。
　　
　　輜重營(yíng)主將依然還是馬升，為廣毅都尉；原騎兵營(yíng)更名為驍騎營(yíng)，本來(lái)幕僚府商議，全卓會(huì)被封為飛騎都尉。
　　
　　但齊王王爭(zhēng)并不同意，特封驍騎營(yíng)主將全卓為顯武飛將軍，編為五大將之外，與全卓一樣編為五大將之外，并且擁有將軍號(hào)的人還有原水軍統(tǒng)領(lǐng)江大。
　　
　　江大可謂是威名赫赫，在水軍之中排在當(dāng)之無(wú)愧的首位，陸軍全面整改之后，原山東水師更名為定海軍，下轄臺(tái)灣艦隊(duì)與東南艦隊(duì)。
　　
　　江大任定海軍主將，為節(jié)海將軍，劉四任定海軍副將，為顯略都尉。
　　
　　這還沒(méi)完，南京禁軍有四大營(yíng)，這就說(shuō)明將會(huì)從其余戰(zhàn)將眾人中選出一個(gè)，原地晉升為禁軍大將，這可是一步登天的機(jī)遇。
　　
　　就在齊軍內(nèi)部為此爭(zhēng)論的時(shí)候，人選卻悄然揭示。
　　
　　原山東軍戰(zhàn)將秦良士，祖籍遼東，崇禎十四年入山東軍，先后在登州、萊州等地的緝鹽行動(dòng)中立下大功，敘列二等功。
　　
　　崇禎十四年底鹽丁大比武中，秦良士位列榜首，充任嫡系正兵什長(zhǎng)。
　　
　　至今三年間，秦良士立二等功八次，三等功十四次，是安平滅鄭之戰(zhàn)中首位登上城頭的山東軍將領(lǐng)，此戰(zhàn)中秦良士奮勇當(dāng)先，斬殺鄭氏主將一員，協(xié)將三名，敘列一等功。
　　
　　魯監(jiān)國(guó)元年七月，秦良士累功晉升禁軍第五營(yíng)主將，封定遠(yuǎn)將軍。
　　
　　秦良士的事跡由此而激發(fā)其它齊軍將領(lǐng)的奪功熱潮，這可是活脫脫一位從底層鹽丁做起，如今位列五大將軍之一的例子。
　　
　　在齊軍內(nèi)，只要你踏實(shí)肯干，總有出頭之日，只要你作戰(zhàn)勇敢且不畏強(qiáng)敵，總有斬獲首功，敘列晉升的那一天。
　　
　　除了將戰(zhàn)兵一系改組為禁軍之外，齊軍取消外系兵馬的諸多編制，只留正兵、輔兵之分，但為了避免質(zhì)量下降，將按照以往軍中的規(guī)定，在已經(jīng)控制的全境內(nèi)重新整改外系兵馬。
　　
　　這次整改從五月份持續(xù)到七月底，裁撤了一大批原明軍將校兵卒，將他們遣返回家，想要種田的有家室者可以到農(nóng)務(wù)部分署入冊(cè)獲得田畝，那些單打獨(dú)斗的，可供選擇的地方也不少。
　　
　　例如各處逐漸興起的礦場(chǎng)、海事局作坊、以及山東沿海一帶的鹽場(chǎng)、鹽田，城管局下轄各司分署，甚至到農(nóng)莊中做幫工都能滿足最基本的溫飽。
　　
　　通過(guò)整改的原外系軍全部原地晉升為正兵，分散在各地駐守。
　　
　　王爭(zhēng)首度開創(chuàng)了村鎮(zhèn)衛(wèi)營(yíng)，州府城防營(yíng)、首都禁軍的三級(jí)統(tǒng)籌陸軍編制，第一批的人員將按照戰(zhàn)功等級(jí)來(lái)分派，這也是從最初戰(zhàn)兵、正兵、外系的三級(jí)編制演變而來(lái)。
　　
　　此次整改之后，齊王下令，城管局保安司諸多丁口自此只能負(fù)責(zé)地方治安，不能再直升進(jìn)入軍隊(duì)。